Smooth Models for Animal Movement
The collection of animal movement data has grown fast, and increasingly complex statistical models are used to understand mechanisms behind animal space use. I will present several key aims of movement studies, such as quantifying inter-individual differences, estimating circadian and seasonal behavioural patterns, and accounting for unobserved spatial variables. I will explain how those features can all be modelled within a framework analogous to generalised additive (mixed) models. I will describe a flexible implementation method using the package mgcv for model specification, and Template Model Builder (TMB) for model fitting. I will then present three projects where we have applied these ideas to movement data from various species: (1) describing behavioural dynamics with hidden Markov models, (2) understanding how the environment shapes animals' movement with step selection functions, and (3) modelling movement in continuous time with stochastic differential equations.
Modèles lisses pour les déplacements d'animaux
La collecte de données sur les déplacements des animaux se développe rapidement, et des modèles statistiques de plus en plus complexes sont utilisés pour comprendre les mécanismes qui sous-tendent l'utilisation de l'espace par les animaux. Je présenterai plusieurs objectifs clés des études sur les mouvements, tels que la quantification des différences interindividuelles, l'estimation des schémas comportementaux circadiens et saisonniers, et la prise en compte de variables spatiales non observées. J'expliquerai comment ces caractéristiques peuvent toutes être modélisées dans un cadre analogue aux modèles additifs généralisés (mixtes). Je décrirai une méthode de mise en oeuvre flexible utilisant le paquet mgcv pour la spécification du modèle, et Template Model Builder (TMB) pour l'estimation du modèle. Je présenterai ensuite trois projets dans lesquels nous avons appliqué ces idées aux données de mouvement de diverses espèces : d'abord décrire la dynamique comportementale avec des modèles de Markov cachés, ensuite comprendre comment l'environnement façonne le mouvement des animaux avec des fonctions de sélection des étapes, et enfin modéliser le mouvement en temps continu avec des équations différentielles stochastiques.
Date and Time
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Language of Oral Presentation
English
Language of Visual Aids
French