Joint Bayesian Hierarchical Model for Binary and Survival Outcomes in Basket Clinical Trials
Recent developments of phase II cancer clinical trials involve a new type of trial called basket trials. In these trials, a proposed treatment is evaluated simultaneously in patients with different types of cancer who share the same genetic mutation. It is common to observe heterogeneity in treatment response and survival across the various cancer types. We propose a Bayesian hierarchical model to group cancer types into distinct clusters. Our methodology combines binary treatment response and right-censored time-to-event data to cluster the cancer types. The adaptive information borrowing across cancer types within a cluster allows for small sample size (rare) cancers to be studied. Our model shows strong efficiency gains over an independent analysis in simulations. We conclude with an application to the precision medicine-1 (PM1) basket trial held at the Canadian Cancer Trial Group (CCTG).
Modèle hiérarchique bayésien conjoint pour données binaires et de survie dans les essais panier cliniques
Les développements récents des essais cliniques de phase II sur le cancer impliquent un nouveau type d'essai appelé essais panier. Dans ces essais, un traitement proposé est évalué simultanément chez des patients atteints de différents types de cancer et partageant la même mutation génétique. Il est courant d'observer une hétérogénéité de la réponse au traitement et de la survie entre les différents types de cancer. Nous proposons un modèle hiérarchique bayésien pour regrouper les types de cancer en grappes distinctes. Notre méthodologie combine la réponse binaire au traitement et les données de survie censurées à droite pour regrouper les types de cancer. L'emprunt d'informations adaptatives entre les types de cancer au sein d'un groupe permet d'étudier des cancers rares (petit échantillon). Notre modèle montre des gains d'efficacité importants par rapport à une analyse indépendante dans les simulations. Nous concluons par une application à l'essai panier de médecine de précision-1 (PM1) organisé par le Canadian Cancer Trial Group (CCTG).
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