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Considerations for Statistical Modelling of Wastewater-Based Viral Signal: An Interlaboratory Comparison
Large-scale wastewater-based surveillance programs provide valuable information about the spread and burden of viruses over time. In these programs, wastewater samples are analyzed by laboratories to measure viral load at multiple locations using polymerase chain reaction. Viral load is measured using the number of the copies of a target gene per mL, which is based on cycle threshold. Consequently, viral load measured using different methodology may not be comparable. I will present the results of mixed-effects modelling on an interlaboratory study in which wastewater samples were divided and independently analyzed by 12 laboratories across Ontario. Results indicate there are significant differences in the measurement of viral load based on which laboratory performed the analysis, even when applying corrections for varying methodology. I will discuss the implications of these findings when modelling viral load, using the Ontario Wastewater Surveillance Initiative data as a case study.
Considérations relatives à la modélisation statistique des signaux viraux dans les eaux usées : Comparaison interlaboratoires
Les programmes de surveillance à grande échelle basés sur les eaux usées fournissent des informations précieuses sur la propagation et la charge virale au fil du temps. Dans le cadre de ces programmes, des échantillons d'eaux usées sont analysés par des laboratoires afin de mesurer la charge virale à plusieurs endroits à l'aide de la réaction en chaîne par polymérase. La charge virale est mesurée à partir du nombre de copies d'un gène cible par ml, qui est basé sur le seuil de cycle. Par conséquent, les charges virales mesurées à l'aide de différentes méthodologies peuvent ne pas être comparables. Je présenterai les résultats d'une modélisation à effets mixtes réalisée dans le cadre d'une étude interlaboratoires dans laquelle des échantillons d'eaux usées ont été répartis et analysés indépendamment par 12 laboratoires de l'Ontario. Les résultats indiquent qu'il existe des différences significatives dans la mesure de la charge virale selon le laboratoire qui a effectué l'analyse, même en appliquant des corrections pour tenir compte des différences de méthodologie. Je discuterai des implications de ces résultats pour la modélisation de la charge virale, en utilisant les données de l'Ontario Wastewater Surveillance Initiative comme étude de cas.
Date and Time
-
Additional Authors and Speakers (not including you)
Nada Hegazy
University of Ottawa
Ken Peng
University of Ottawa
Elizabeth Renouf
University of Ottawa
X. Joan Hu
Simon Fraser University
Charmaine Dean
University of Waterloo
Robert Delatolla
University of Ottawa
Language of Oral Presentation
English
Language of Visual Aids
English

Speaker

Edit Name Primary Affiliation
Johanna de Haan-Ward University of Ottawa