Description
The data come from a graduate student, Lisa Ruemper, in the Department of Biology at the University of Waterloo. She is working in conjunction with researchers at the Canadian Centre of Inland Waters in Burlington, Ontario.
The researchers were interested in the effect of the effluents released over past years by a pulp mill on the Kapuskasing River in Ontario. In particular, they were interested in seeing if the effluent has affected the growth pattern of a particular species of fish, white sucker.
Using electro-fishing, they sampled fish from three different sites in September over three years, 94, 95 and 96. (Note that the sampling was destructive, so that different fish were obtained each year.) One site, up2, was 30 km upstream of the pulp mill and so remained unaffected by the effluent. The other two sites, downtb and downff, were downstream of the pulp mill, either directly below (downtb) or 15 km below (downff).
Many measurements were taken but those of interest are related to the growth of the fish. For each year of growth, a ring is laid down on the bony gill cover (opercula) similar to that on a slice from a tree trunk except that the opercula is fan shaped rather than circular. On each fish, the increment length (mm.) (i.e. the distance from the center of the opercula to the first ring or the perpendicular distance between successive rings) is measured; there will be one for each year of growth, so that a fish aged nine, say, will have nine such increments. While the researchers were able to determine exactly how many rings there were on each opercula, some of the increment lengths are missing, particularly for age 1 and 2, because the associated rings were not clearly visible. The total distance from the center to the edge of the gill cover is thought to be related to the fork length (cm.) (the length from the fish's 'nose' to the fork in its tail), a commonly used measure for size and age of the fish.
The primary objective of your analysis should be the testing of whether there is a difference in growth pattern among the three sites, allowing for possible environmental effects from year to year. Lisa was also interested in estimating the magnitude of these growth differences among the sites. You might assume that the fish in the three sites come from the same population of white suckers and that each sample taken is a random sample from that population.
- Quand est-ce que les études de cas auront-elles lieu?
Les équipes peuvent commencer leurs analyses dès maintenant. Toutefois, elles doivent s'inscrire avant le 15 mars auprès de Jeanette O'Hara Hines (johara@uwaterloo.ca). Les résultats seront présentés lors de sessions spéciales au congrès 1998 de la SSC à Sherbrooke qui aura lieu du 31 mai au 3 juin 1998. - Quel sera le format des conférences?
Tous les détails ne sont pas encore déterminés, mais en plus des présentations par les équipes, il y aura du temps pour des discussions constructives sur les analyses et les présentations. - Quant aux données concernant les rejets dans la rivière Kapuskasing, y-a-t-il eu de la migration des poissons entre les sites?
Non, on suppose qu'il n'y a pas eu de migration. C'était très improbable, à cause des barrières naturelles et artificielles. - Quant aux mêmes données, comment calculons-nous la croissance cumulative?
Le biologiste qui a soumis ces données n'est pas intéressé à cette mesure particulière, donc elle n'a pas été inclue dans l'ensemble de données. Cependant, il a l'information, et donc une nouvelle copie des données est maintenant disponible. Cet ensemble de données inclue toutes les valeurs précédentes, plus une nouvelle variable, CINGROW, croissance cumulative de mesure, placée entre les variables INAGE et INGROW.
Les données sont contenues dans le fichier ASCII operc.txt, et les variables qui s'y trouvent sont, dans l'ordre:
- date de capture (DATE$),
- site de capture (SITE$),
- # de poisson (FISH),
- longueur de fourche (FLEN),
- âge du poisson (FAGE),
- année de naissance du poisson (YRCLASS),
- âge de l'accroissement mesuré (INAGE),
- longueur de l'accroissement mesuré (INGROW), et
- et année de calendrier où l'accroissement mesuré a eu lieu (YRGROW).
Veuillez prendre note que les accroissements manquant sont dénotés par un point seul "." et que les noms des variables sont dans la premiere rangée du fichier. Si vous avez des questions sur ces données, vous pouvez communiquer avec moi (Jeanette O'Hara Hines) par courrier électronique à johara@uwaterloo.ca.
Merci bien à Thierry Duchesne pour la traduction française.