SSC 2011 Étude de cas 2

Déterminants de la présence et du volume de graisse brune chez les humains

Dernière modification : 2011-01-22
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Sommaire

Remerciements

Merci au Centre d’imagerie moléculaire de l’Université de Sherbrooke pour les données.

Pour toute question, veuillez contacter Lajmi Lakhal-Chaieb du Département de mathématiques et de statistique à l’Université Laval.

Objectif

L’objectif de cette analyse est d’identifier les facteurs qui déterminent l’existence et le volume de graisse brune chez les humains.

Contexte

Il est bien connu que la graisse brune permet à certains animaux de petite taille de survivre dans un environnement froid. On pensait jusqu’à récemment que pour les humains, cette graisse n’était présente que chez les nouveaux-nés. Mais de récents progrès technologiques ont permis d’en détecter la présence chez les adultes aussi. Cette graisse doit être activée par une température ambiante basse pour être détectée au scanner, car l’exposition au froid en augmente la prévalence, qui varie considérablement d’une étude à l’autre. Toutefois, l’importance des facteurs qui déterminent l’existence et le volume de graisse brune chez les adultes restent à étudier. Le principal objectif de cette étude est d’examiner la relation entre plusieurs facteurs et la présence et le volume de graisse brune dans une grande cohorte de patients atteints de cancer.

Questions

Les étudiants pourront se pencher sur les questions suivantes :

  1. Étudier la relation entre chacune des covariables et la présence et le volume de graisse brune, séparément.
  2. Construire des modèles pour estimer la probabilité d’avoir de la graisse brune et en prédire le volume.
  3. En fait, il existe quatre schémas de graisse brune différents : Cervical, Paravertébral, Médiastinal et Périrénal. Effectuer l’analyse précédente en tenant compte des résultats multivariés.

Données

Un ensemble de données (CSV, XLS) contenant des enregistrements concernant 4 842 patients atteints de cancer est fourni pour l’analyse. Cet ensemble de données contient toutes les variables explicatives et de réponse, à savoir :

  • Sexe : sexe du patient (Féminin=1, Masculin=2).
  • Diabetique : diabète (Non=0, Oui=1).
  • Age : Âge du patient en années.
  • Jour_unique : Jour de l’année.
  • Mois_examen : Mois de l’examen.
  • Temp_ext : Température extérieure.
  • Temp_2jrs : Température moyenne des 2 derniers jours.
  • Temp_3jrs : Température moyenne des 3 derniers jours.
  • Temp_7jrs : Température moyenne des 7 derniers jours.
  • Temp_1mois : Température moyenne du dernier mois.
  • Saison : Printemps=1, Été=2, Automne=3, Hiver=4.
  • Duree_soleil : Heures d’ensoleillement.
  • Poids: Poids en kg.
  • Taille: Taille en cm.
  • IMC: Indice de masse corporelle.
  • Glycemie : Glycémie
  • LBW : Masse maigre
  • Statut_cancer : Patient atteint de cancer (Non=0, Oui=1).
  • Type_cancer : Type de cancer (Aucun=0, poumon=1, digestif=2, oto-rhino-laryngologie=3, sein=4, gynécologique (femme)=5, génital (homme)=6, urothélial=7, rein=8, cerveau=9, peau=10, thyroïde=11, prostate=12, lymphome non hodgkinien=13, Hodgkin=14, Kaposi=15, myélome=16, leucémie=17, autre=18).
  • TSH
  • GraisseBrune : graisse brune (Non=0, Oui=1).
  • vol_total : Volume total de graisse brune.
  • vol_cervical : Volume de graisse cervicale.
  • vol_paraspinal : Volume de graisse paravertébrale.
  • vol_mediastinal : Volume de graisse médiastinale.
  • vol_infradiaphragme : Volume de graisse périrénale. 

Foire aux questions

Références