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Bayesian Variable Selection for Logistic Regression with Applications in Biomedical Data
This study presents a Bayesian variable selection (BVS) method for logistic regression, incorporating both a fixed prior, which assumes equal prior probabilities for the model parameters, and a flexible prior, which allows for unequal probabilities. The method was applied to two datasets: Coronary Artery Disease (CAD) and Breast Cancer (BC). For CAD, the proposed method selected ST slope, fasting blood sugar, and exercise-induced ST depression as significant predictors, each with a posterior inclusion probability (PIP) of 0.99. Our proposed method detected more significant predictors than its competitor. For BC, our method identified 20 significant genes, with SERPINA1 emerging as the most important, with a PIP of 0.99. Also, our method provided better precision in estimates by yielding narrower credible intervals for genes such as SUSD3 and RGS4, among others. These findings provide valuable insights into CAD and BC, potentially enhancing personalized treatment strategies.
Sélection bayésienne de variables pour la régression logistique avec applications aux données biomédicales
Cette étude présente une méthode bayésienne de sélection de variables (BVS) pour la régression logistique, incorporant à la fois un a priori fixe, qui suppose des probabilités a priori égales pour les paramètres du modèle, et un a priori flexible, qui permet des probabilités inégales. La méthode a été appliquée à deux ensembles de données : un sur la maladie coronarienne (MC) et un sur le cancer du sein (CS). Pour la MC, la méthode proposée a sélectionné la pente du segment ST, la glycémie à jeun et le sous-décalage du segment ST induit par l'exercice comme prédicteurs significatifs, chacun avec une probabilité d'inclusion a posteriori (PIP) de 0,99. La méthode proposée a détecté plus de prédicteurs significatifs que sa concurrente. Pour le CS, notre méthode a identifié 20 gènes significatifs, SERPINA1 apparaissant comme le plus important, avec une PIP de 0,99. En outre, notre méthode a fourni une meilleure précision dans les estimations en produisant des intervalles crédibles plus étroits pour des gènes tels que SUSD3 et RGS4, entre autres. Ces résultats fournissent des informations précieuses sur la maladie coronarienne et le cancer de la prostate, ce qui pourrait permettre d'améliorer les stratégies de traitement personnalisées.
Date and Time
-
Co-auteurs (non y compris vous-même)
Jabed Tomal
Thompson Rivers University
Langue de la présentation orale
Anglais
Langue des supports visuels
Anglais

Speaker

Edit Name Primary Affiliation
Ayisha Najeeha COK Thompson Rivers University